ジョー・ローガンは偽りの姿であった。その正体は組織を抜けた忍「ヒガン」。
彼が居た忍び組織は、元々日本に属していたが、世界情勢の変化と頭領の交代により大国の配下となっていた。
ヒガンは妻子の復讐のため、組織を潰す決意を固め、ひとり組織のアジトへ向かう。
しかしそこは既にもぬけのからだった。更なる情報を得るため、ヒガンはFBI捜査官マイクにコンタクトをとる。それぞれの思惑を秘めて落ち合った先で、彼らが出会うのは――。